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国家重点学科，首批硕士、博士授予权学科，国家卫生部首批内镜诊疗技术培训基地，全军普通外科中心，重庆市医学重点学科，西南医院微创胃肠外科中心，西南医院肿瘤生物治疗中心，首批西南医院研究型特色专科。目前已经形成了以胃肠外科、结直肠肛门外科、腹壁与疝外科和血管外科为特色的综合性学科。在国内率先开展了腹腔镜胃癌根治术，至今已完成国际报道的单中心最大宗病例，主持制定了《中国腹腔镜胃癌手术操作指南》，有力推动了该项技术在国内广泛规范化开展;在国内较早开展了超低位直肠的保肛手术，在军内率先开展了腹腔镜TME直肠癌根治术、腹腔镜直肠癌超低位保肛术和腹腔镜全结肠切除术等手术。在军内和西部地区率先开展了系列腹腔镜疝修补术、包括腹腔镜经腹和腹膜外疝修补术、腹腔镜嵌顿疝松解修补术和腹腔镜复发疝修补术，达到国内先进、军内领先水平。