我院应卫生部三等甲级医院须设立心理门诊的规定要求，于1990年成立了临床心理咨询门诊，是重庆市首家在综合医院开展此项工作的单位。随着社会节奏的加快，生存压力的加剧，人与人之间的隔离和生疏，患心理障碍、心理疾病的人越来越多，综合医院已成为心理疾病患者主要选择求助的医疗机构，为了顺应社会对心理服务的需求，心理门诊工作人员通过自身的不断探索与诊治水平的不断提高，于2000年成立了临床心理咨询中心（院级中心），隶属神经内科。为了贯彻执行总部对心理卫生工作的重视，与心理卫生工作在部队的落实，院党委及时把握疾病谱的变化与动向，于2009年5月正式成立了临床心理科。 目前，科室占地面积近450平方米，设有七个功能治疗单元。为了适应医学模式转变，我科率先在重庆市开展心理治疗，变传统药物治疗为药物联合心理的整合治疗，是在西部地区及全军开展心理治疗最早的单位之一。目前，我科开展的心理治疗手段有十余种，包括认知行为、精神分析、催眠、人本主义、生物反馈、团体治疗等，专设了军人心理咨询门诊及军人心理咨询专线电话。是目前军内开展心理治疗手段最完善的单位之一。 2009年10月，在我校承办的全军心理卫生工作座谈会上，我科作为唯一的临床现场展示点，接受了全军心理座谈会各级领导及专家检查，得到与会领导和专家高度评价与认可。 2010年获总后获批“全军临床心理治疗中心”。